Hi everybody,<br>
<br>
I am trying to save a raw image. I do the following<br>
<br>
<br>
compute2 104% brains2<br>
Parsing brains2 configuration file (/opt/brains2/bin/brains2rc).<br>
Parsing brains2 configuration file (/raid0/homes/lacion/.brains2rc).<br>
&nbsp;cor:GLX DP(2):GLX_RGBA,GLX_RED_SIZE,8,GLX_GREEN_SIZE,8,GLX_BLUE_SIZE,8,GLX_ALPH<br>
A_SIZE,8,GLX_DEPTH_SIZE,16,GLX_DOUBLEBUFFER<br>
GLX DP(2):GLX_RGBA,GLX_RED_SIZE,8,GLX_GREEN_SIZE,8,GLX_BLUE_SIZE,8,GLX_ALPHA_SIZ<br>
E,8,GLX_DEPTH_SIZE,16,GLX_DOUBLEBUFFER<br>
GLX DP(2):GLX_RGBA,GLX_RED_SIZE,8,GLX_GREEN_SIZE,8,GLX_BLUE_SIZE,8,GLX_ALPHA_SIZ<br>
E,8,GLX_DEPTH_SIZE,16,GLX_DOUBLEBUFFER<br>
GLX DP(2):GLX_RGBA,GLX_RED_SIZE,8,GLX_GREEN_SIZE,8,GLX_BLUE_SIZE,8,GLX_ALPHA_SIZ<br>
E,8,GLX_DEPTH_SIZE,16,GLX_DOUBLEBUFFER<br>
&nbsp;axi: sag:surf:b2 show viewer tracker <br>
sourcing: /opt/brains2/bin/scripts/iplTkScripts/ipltkfbox.tcl <br>
b2 hide viewer axi <br>
b2 show viewer axi <br>
b2 hide viewer cor <br>
b2 show viewer cor <br>
b2 hide viewer sag <br>
b2 show viewer sag <br>
b2 hide viewer surf <br>
b2 show viewer surf <br>
b2 hide viewer tracker <br>
b2 load Image /IPLlinux/raid1/structural/bob_MR/0193323/2005.07.05_11.03/0014/MR<br>
_0014_0001.dcm data-type= unsigned-8bit <br>
Object loaded with filter: gdcm<br>
number of distinct pixel values: 671<br>
WARNING:&nbsp; 'b2 load image' is loading an image of type UNSIGNED_16BIT into image <br>
memory of type UNSIGNED_8BIT.<br>
This will exercise voxel conversion logic that attempts to preserve the nature o<br>
f the data as per the image file.<br>
b2 save image /IPLlinux/raid1/structural/bob_MR/0193323/2005.07.05_11.03/10_ACPC<br>
/FLAIR_raw.dcm strictAnalyze75 i1 data-type= unsigned-8bit plane= coronal <br>
<br>
I get the following<br>
<br>
SIMPLE_ERROR Failed to write image to the specified filter Module
/scratch/hjohnson/src/brains2/src/iplKernel/bkrwImage.cxx Function
bk_saveImage Lines 2218 Code 123456789<br>
<br>
I tried also a nifti format and the axial plane with similar errors. I
run it on compute2 and on my own computer with the same result.<br>
<br>
any ideas?<br>
Thanks a lot for your help with this!<br>
Best wishes,<br>
Laura