Hi Amanda,<div><br></div><div>I&#39;m surprised with this error. I&#39;m assuming these data were acquired using a product sequence? Are the data stored as a mosaic image? In any case, the easiest thing would be to send me an example dataset, preferably using Dropbox (linked to this email address).</div>

<div><br></div><div>Cheers,</div><div><br></div><div>Donald.</div><div><br></div><div><br><div class="gmail_quote">On 16 April 2012 01:34, Amanda Ng <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:amanda.ng@monash.edu">amanda.ng@monash.edu</a>&gt;</span> wrote:<br>

<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi,<br>
<br>
mrconvert fails when run on Siemens Skyra DTI dicom datasets. The<br>
following is the output<br>
<br>
mrconvert: scanning DICOM folder<br>
&quot;../dicom_series/21_ep2d_diff_mddw_30_p2/&quot;  - ok<br>
mrconvert: reading DICOM series &quot;ep2d_diff_mddw_30_p2&quot;... 100%<br>
Assertion failed: (!gsl_isnan(distance)), function operator&lt;, file<br>
lib/file/dicom/image.cpp, line 191.<br>
Abort trap: 6<br>
<br>
I can provide an example dataset if required.<br>
<br>
Thanks,<br>
Amanda<br>
_______________________________________________<br>
Mrtrix-discussion mailing list<br>
<a href="mailto:Mrtrix-discussion@www.nitrc.org">Mrtrix-discussion@www.nitrc.org</a><br>
<a href="http://www.nitrc.org/mailman/listinfo/mrtrix-discussion" target="_blank">http://www.nitrc.org/mailman/listinfo/mrtrix-discussion</a><br>
</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br>Jacques-Donald Tournier (PhD)<br>Brain Research Institute, Melbourne, Australia<br>Tel: +61 (0)3 9035 7033<br>
</div>