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  <head>

    <meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=ISO-8859-1">
  </head>
  <body bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
    Hi list,<br>
    I'm quite new to MRtrix and I thought it would be really useful to
    use the patch that allows Gzip .nii and .mif to be processed.
    However, I stuck with the installation and wonder if someone can
    help.<br>
    I downloaded the patch and untarred it:<br>
    jcole@ubuntu:~$ tar xvfj mrtrix-patch-GZ.tar-0001.bz2 <br>
    build<br>
    lib/image/format/list.cpp<br>
    lib/image/format/mrtrix.cpp<br>
    lib/image/format/nifti1.cpp<br>
    lib/image/mapper.cpp<br>
    lib/image/mapper.h<br>
    lib/image/object.cpp<br>
    lib/image/object.h<br>
    sysconf/linux.py<br>
    sysconf/darwin.py<br>
    sysconf/windows.py<br>
    <br>
    But then got the following error when building:<br>
    trackhd@ubuntu:~$ ./build<br>
    Traceback (most recent call last):<br>
    &nbsp; File "./build", line 61, in &lt;module&gt;<br>
    &nbsp;&nbsp;&nbsp; exec 'from sysconf.' + system.lower() + ' import *'<br>
    &nbsp; File "&lt;string&gt;", line 1, in &lt;module&gt;<br>
    ImportError: No module named sysconf.linux<br>
    <br>
    I tried a clean build, but gave the same error. Any thoughts on how
    to overcome this would be great.<br>
    I'm running MRtrix on an Ubuntu VMware player VM on RHEL 5.3<br>
    <br>
    Thanks,<br>
    James<br>
    <br>
    <div class="moz-signature">-- <br>
      <b>James Cole PhD | Research Associate | Huntington's Disease
        Research Group | Institute of Neurology | University College
        London</b></div>
  </body>
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