
<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">

<HTML><HEAD>

<META content="text/html; charset=gb2312" http-equiv=Content-Type>

<STYLE>

BLOCKQUOTE {

        MARGIN-TOP: 0px; MARGIN-BOTTOM: 0px; MARGIN-LEFT: 2em

}

OL {

        MARGIN-TOP: 0px; MARGIN-BOTTOM: 0px

}

UL {

        MARGIN-TOP: 0px; MARGIN-BOTTOM: 0px

}

P {

        MARGIN-TOP: 0px; MARGIN-BOTTOM: 0px

}

BODY {

        LINE-HEIGHT: 1.5; FONT-FAMILY: 微软雅黑; COLOR: #000000; FONT-SIZE: 10.5pt

}

</STYLE>


<META name=GENERATOR content="MSHTML 9.00.8112.16455"></HEAD>

<BODY style="MARGIN: 10px">

<DIV>

<DIV><SPAN 

style="TEXT-TRANSFORM: none; TEXT-INDENT: 0px; LETTER-SPACING: normal; DISPLAY: inline !important; FONT: 12pt Times New Roman; WHITE-SPACE: normal; FLOAT: none; WORD-SPACING: 0px">Hi,</SPAN></DIV>

<DIV><SPAN 

style="TEXT-TRANSFORM: none; TEXT-INDENT: 0px; LETTER-SPACING: normal; DISPLAY: inline !important; FONT: 12pt Times New Roman; WHITE-SPACE: normal; FLOAT: none; WORD-SPACING: 0px"></SPAN>&nbsp;</DIV>

<DIV><SPAN 

style="TEXT-TRANSFORM: none; TEXT-INDENT: 0px; LETTER-SPACING: normal; DISPLAY: inline !important; FONT: 12pt Times New Roman; WHITE-SPACE: normal; FLOAT: none; WORD-SPACING: 0px">I 

have a question about the gradient direction table used in Mrtrix. The gradient 

direction table achieved from the DICOM images with dcm2nii is different from 

the table achieved with the command 'mrinfo DICOMDIR -grad encoding.b'. I 

checked the source code of Mrtrix and found the following codes '</SPAN></DIV>

<DIV><SPAN 

style="TEXT-TRANSFORM: none; TEXT-INDENT: 0px; LETTER-SPACING: normal; DISPLAY: inline !important; FONT: 12pt Times New Roman; WHITE-SPACE: normal; FLOAT: none; WORD-SPACING: 0px"></SPAN><SPAN 

style="TEXT-TRANSFORM: none; TEXT-INDENT: 0px; LETTER-SPACING: normal; DISPLAY: inline !important; FONT: 12pt Times New Roman; WHITE-SPACE: normal; FLOAT: none; WORD-SPACING: 0px">if(rotate_DW_scheme)</SPAN></DIV>

<DIV 

style="TEXT-TRANSFORM: none; TEXT-INDENT: 0px; LETTER-SPACING: normal; FONT: medium Tahoma; WHITE-SPACE: normal; WORD-SPACING: 0px">

<DIV style="FONT-FAMILY: Times New Roman; FONT-SIZE: 12pt">{</DIV>

<DIV style="FONT-FAMILY: Times New Roman; FONT-SIZE: 12pt">G(n,0) = 

image_transform(0,0) * d[0] + image_transform(0,1) * d[1] - image_transform(0,2) 

* d[2];</DIV>

<DIV style="FONT-FAMILY: Times New Roman; FONT-SIZE: 12pt">G(n,1) = 

image_transform(1,0) * d[0] + image_transform(1,1) * d[1] - image_transform(1,2) 

* d[2];</DIV>

<DIV style="FONT-FAMILY: Times New Roman; FONT-SIZE: 12pt">G(n,2) = 

image_transform(2,0) * d[0] + image_transform(2,1) * d[1] - image_transform(2,2) 

* d[2];</DIV></DIV>

<DIV><SPAN 

style="TEXT-TRANSFORM: none; TEXT-INDENT: 0px; LETTER-SPACING: normal; DISPLAY: inline !important; FONT: 12pt Times New Roman; WHITE-SPACE: normal; FLOAT: none; WORD-SPACING: 0px">}</SPAN><SPAN 

style="TEXT-TRANSFORM: none; TEXT-INDENT: 0px; LETTER-SPACING: normal; DISPLAY: inline !important; FONT: 12pt Times New Roman; WHITE-SPACE: normal; FLOAT: none; WORD-SPACING: 0px">' 

in image.cpp.</SPAN></DIV>

<DIV><SPAN 

style="TEXT-TRANSFORM: none; TEXT-INDENT: 0px; LETTER-SPACING: normal; DISPLAY: inline !important; FONT: 12pt Times New Roman; WHITE-SPACE: normal; FLOAT: none; WORD-SPACING: 0px">I 

transformed the original gradient table with similar code in Matlab, but the 

result is not equal to the table achieved with mrinfo. So I want to know the 

procedure of transforming the original gradients to the gradients achieved with 

mrinfo. And why is it '</SPAN><SPAN 

style="TEXT-TRANSFORM: none; TEXT-INDENT: 0px; LETTER-SPACING: normal; DISPLAY: inline !important; FONT: 12pt Times New Roman; WHITE-SPACE: normal; FLOAT: none; WORD-SPACING: 0px">G(n,0) 

= image_transform(0,0) * d[0] + image_transform(0,1) * d[1] - 

image_transform(0,2) * d[2];</SPAN><SPAN 

style="TEXT-TRANSFORM: none; TEXT-INDENT: 0px; LETTER-SPACING: normal; DISPLAY: inline !important; FONT: 12pt Times New Roman; WHITE-SPACE: normal; FLOAT: none; WORD-SPACING: 0px">' 

rather than '</SPAN><SPAN 

style="TEXT-TRANSFORM: none; TEXT-INDENT: 0px; LETTER-SPACING: normal; DISPLAY: inline !important; FONT: medium Tahoma; WHITE-SPACE: normal; FLOAT: none; WORD-SPACING: 0px"><SPAN 

style="FONT-FAMILY: Times New Roman; FONT-SIZE: 12pt">G(n,0) = 

image_transform(0,0) * d[0] + image_transform(0,1) * d[1] + image_transform(0,2) 

* d[2];' ?</SPAN></SPAN></DIV></DIV>

<DIV style="FONT-FAMILY: Times New Roman; FONT-SIZE: 12pt">&nbsp;</DIV>

<DIV style="FONT-FAMILY: Times New Roman; FONT-SIZE: 12pt">Thanks.</DIV>

<DIV style="FONT-FAMILY: Times New Roman; FONT-SIZE: 12pt">&nbsp;</DIV>

<DIV style="FONT-FAMILY: Times New Roman; FONT-SIZE: 12pt">Sangma Xie</DIV>

<HR style="WIDTH: 210px; HEIGHT: 1px" align=left color=#b5c4df SIZE=1>


<DIV><SPAN>

<DIV><SPAN style="FONT-FAMILY: 宋体; COLOR: #000000; FONT-SIZE: 10.5pt"><SPAN 

style="FONT-FAMILY: Times New Roman"><SPAN style="FONT-SIZE: 10.5pt"><SPAN 

style="FONT-SIZE: 10.5pt">Sangma Xie , Master&nbsp;</SPAN> </SPAN>

<DIV><SPAN style="FONT-FAMILY: Times New Roman">Brainnetome Center 

<DIV style="FONT-FAMILY: Times New Roman">National Laboratory of Pattern 

Recognition (NLPR)</DIV>Institute of Automation, Chinese Academy of Sciences 

(CASIA)<BR>95 Zhong Guan Cun East Road, Hai Dian District, Beijing 100190, 

P.R.China</SPAN></SPAN><BR><BR></DIV></SPAN></DIV></SPAN></DIV></BODY></HTML>