<div dir="ltr">Hi all,<div><br></div><div>If it helps, most of the parameters are described in this paper:</div><div><br></div><div><a href="http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/ima.22005/abstract">http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/ima.22005/abstract</a><br>
</div><div><br></div><div>Cheers,</div><div><br></div><div>Donald.</div><div><br></div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On 18 March 2014 10:19, Manuel Blesa Cábez <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:mblesac@gmail.com" target="_blank">mblesac@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">I found an interesting paper comparing different parameters in mice&#39;s tractography<br><br><a href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2882245/" target="_blank">http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2882245/</a><br>

</div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">2014-03-18 10:18 GMT+01:00 Manuel Blesa Cábez <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:mblesac@gmail.com" target="_blank">mblesac@gmail.com</a>&gt;</span>:<div><div class="h5">
<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div dir="ltr">Hi,<br><br>My images have 120x110x54 voxels, and the voxel size is 1.4x1.4x2.8. The voxel size was multiplied by 10.<br><br>Normally I use probabilistic streamtrack and 10 spherical harmonics. But the rest of parameters like streamlines, curvature, step, etc... I don&#39;t know, I&#39;m trying to find some papers but at the moment I didn&#39;t find anything.<br>


<br>Regards,<br><br>Manuel Blesa<br></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">2014-03-17 20:12 GMT+01:00 Manuel Blesa Cábez <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:mblesac@gmail.com" target="_blank">mblesac@gmail.com</a>&gt;</span>:<div>

<div><br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div>Dear all,</div><div><br></div><div>I&#39;m working on small animal brains (mouse) and I don&#39;t know what are the correct parameters to construct the tractography (streamlines, curvature, etc...). Is someone working with similar data and could give me a little reference? Thanks in advance</div>



<div><br></div><div>Best regards,</div><div><br></div><div>Manuel Blesa</div></div>
</blockquote></div></div></div><br></div>
</blockquote></div></div></div><br></div>
<br>_______________________________________________<br>
Mrtrix-discussion mailing list<br>
<a href="mailto:Mrtrix-discussion@www.nitrc.org">Mrtrix-discussion@www.nitrc.org</a><br>
<a href="http://www.nitrc.org/mailman/listinfo/mrtrix-discussion" target="_blank">http://www.nitrc.org/mailman/listinfo/mrtrix-discussion</a><br>
<br></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr"><b><font color="#990000">Dr J-Donald Tournier (PhD)</font></b><br><div><font color="#990000"><br></font></div><i><font color="#990000">Senior Lecturer, </font></i><i><font color="#990000">Biomedical Engineering</font></i><div>
<i><font color="#990000">Division of Imaging Sciences &amp; Biomedical Engineering<br>King&#39;s College London</font></i><div><i><font color="#990000"><br></font></i></div><div><i><font color="#990000"><b style="font-family:Calibri,sans-serif;font-size:15px"><span style="font-size:10pt">A:</span></b><span style="font-family:Calibri,sans-serif;font-size:10pt"> Department of Perinatal Imaging &amp; Health, 1<sup>st</sup> Floor South Wing, St Thomas&#39; Hospital, London. SE1 7EH</span><br>
</font></i></div><div><i><font color="#990000"><b>T:</b> +44 (0)20 7188 7118 ext 53613</font></i></div></div><div><i><font color="#990000"><b>W:</b> <a href="http://www.kcl.ac.uk/medicine/research/divisions/imaging/departments/biomedengineering" target="_blank">http://www.kcl.ac.uk/medicine/research/divisions/imaging/departments/biomedengineering</a></font></i><br>
</div></div>
</div>