<div dir="ltr"><div><div>you haveĀ  multiple mrtrix related crashes.. hard to say without looking at the crash file. <br><br></div>check the crash file by typing <br>$nipype_display_crash &#39;crash_file.......&#39;<br><br></div>a guess is that the mrtrix environ has not been initialized. <br><br>but mabye the nipype guys have some other thoughts. <br><br><br><br></div>