<div dir="ltr">Hi Mrtrix community, <div><br></div><div> Is there a way to have the dimension and orientation of final output from act_anat_prepare_fsl  the same as the input T1 file. </div><div>I have modified the script by skipping &quot;mrcrop&quot;, but in vain to keep the orientation and dimension  the same as the original one. </div><div><br></div><div><br></div><div>Thanks. </div><div><br></div><div>Ping</div></div>