<div dir="ltr"><div dir="ltr">Hello Mrtrix3 users, <br><br>For calculating FDC values mentioned in the <a href="https://mrtrix.readthedocs.io/en/latest/fixel_based_analysis/mt_fibre_density_cross-section.html">https://mrtrix.readthedocs.io/en/latest/fixel_based_analysis/mt_fibre_density_cross-section.html</a>, <br><br>In Step 18,<br><br>foreach * : mrcalc ../template/fd/IN.mif ../template/fc/IN.mif -mult ../template/fdc/IN.mif<br><br>Are the ../template/fd/IN.mif  files the same as those ../template/fd/PRE.mif file, which were the output of Step16,  <div><br>foreach * : fixelcorrespondence IN/fixel_in_template_space/fd.mif ../template/fixel_mask ../template/fd PRE.mif</div><br><br>I was not able to locate the ../template/fd/IN.mif. </div><div dir="ltr"><br></div><div>Thanks. </div><div><br></div><div>Ping</div></div>