<br><div>I am having some problem to understand the color coding of the FOD profile constructed by the CSD method of MRtrix. For my understanding, the color should be the same along the same axis of the FOD. However quite often I see the color changes a lot along the same orientation of FODs. </div>
<div><br></div><div>I attached one example picture of FOD here but not sure if you can see the attachment in this maillist. In this example, the FOD color changes from green to blue in the first primary orientation. What should I interpret it? Does it mean that the primary direction is a mix of diffusion in both green and blue directions? </div>
<div><br></div><div>Thanks, </div><div>Zhuang    </div>