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open-discussion > DRAMMS firt step (FLIRT) fail...
Mar 28, 2020 11:03 AM | thbscbr
DRAMMS firt step (FLIRT) fail...
Hello,
I need help please. I tried to register 2 sacral CT but the procedure fails...
Can you help me please ?
Here is what the verbose showed :
(base) [planet@lito-orsay Desktop]$ dramms -S /home/planet/Desktop/MAR_CT_RECID.nii.gz -T /home/planet/Desktop/MAR_CT_PRERT.nii.gz -O /home/planet/Desktop/MAR_CT_RECID2PRERT.nii.gz -D /home/planet/Desktop/MAR_CT_RECID2PRERT_DEF.nii.gz -v
Automatically mapping regularization weights and label factor to roughly the range [0,1]
Regularization = .35555555555555555554
Label factor = 0.50
Number of Gabor scales = 3
-------------------------------------------------------------------------------------------
DRAMMS: Deformable image Registration via Attribute Matching and Mutual-Saliency weighting
-------------------------------------------------------------------------------------------
----------------------------------------
Registering from
MAR_CT_RECID.nii.gz (in directory /home/planet/Desktop)
to
MAR_CT_PRERT.nii.gz (in directory /home/planet/Desktop),
Registered image will be
MAR_CT_RECID2PRERT.nii.gz (in directory /home/planet/Desktop)
and deformation will be
MAR_CT_RECID2PRERT_DEF.nii.gz (in directory /home/planet/Desktop).
Both registered image and deformation field will be in the same space as MAR_CT_PRERT.nii.gz.
----------------------------------------
Gabor attributes will be computed at 3 scales and in 4 orientations
During discrete optimization, number of samples: 5
Manipulation method of control points: 1
Regularization weight: 0.2
Input mask: NULL
Temporary working directory: /tmp/dramms-VqBDLo
Temporary attribute directory: /tmp/dramms-VqBDLo/features
Intermediate results directory: /tmp/dramms-VqBDLo/intermediate
Changed to directory /tmp/dramms-VqBDLo/intermediate
Step 1: Convert images to byte datatype...
++ WARNING: nifti_read_buffer(/home/planet/Desktop/MAR_CT_PRERT.nii.gz):
data bytes needed = 2048
data bytes input = 49
number missing = 1999 (set to 0)
++ WARNING: nifti_read_buffer(/home/planet/Desktop/MAR_CT_PRERT.nii.gz):
data bytes needed = 2048
data bytes input = 49
number missing = 1999 (set to 0)
Step 2: Match histograms if necessary...
Start to estimate histogram...
TotalIntensityA=1568979839.000000 NonZeroPntsA=18518625.000000
TotalIntensityB=165014657.000000 NonZeroPntsB=9649350.000000
cumulative histogram for A = 1.000000, for B = 1.000000
Entropy A = 4.240346
Entropy B = 2.334679
cumulative histogram for image A:
0.316329 at intensity 12 (perhaps noise),
0.417674 at intensity 51 (lower 1/5 intensity range),
0.984657 at intensity 204 (higher 1/5 intensity range).
cumulative histogram for image B:
0.103504 at intensity 12 (perhaps noise),
0.997653 at intensity 51 (lower 1/5 intensity range),
1.000000 at intensity 204 (higher 1/5 intensity range).
No need to match histogram.
Compare image similarity before and after histogram matching.
before: cc*mi = .715031506181
after : cc*mi = .715031506181
We decided to keep byte images after histogram matching, as histomatch increased image similarity.
Step 3: Affine registration of images by FSL's flirt tool (may take several minutes)...
Try using normmi as similarity metric for affine registration, search range [-180, 180]
Try using corratio as similarity metric for affine registration, search range [-180, 180]
Selecting best affine registration results
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 335 : printf: 1.032195984: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 336 : printf: 0.0217732997: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 337 : printf: -0.01392433965: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 338 : printf: -0.0007671974302: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 339 : printf: 1.00972434: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 340 : printf: -0.002290940197: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 341 : printf: 0.01662321697: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 342 : printf: 0.007026530255: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 343 : printf: 0.346018679: nombre non valable
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 356 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 357 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 358 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 359 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 360 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 361 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 2: syntax error
when sim=normmi180: mi_inter=1.561389, cc_inter=0.964641, mi_inter*cc_inter=; mi_full=1.356784, cc_full=0.544964, mi_full*cc_full=.739398435776
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1439 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1442 : [: == : op????rateur unaire attendu
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 335 : printf: 1.033756639: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 336 : printf: -0.02667788233: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 337 : printf: -0.002680037682: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 338 : printf: 0.02833808746: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 339 : printf: 1.032154778: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 340 : printf: 0.0214324315: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 341 : printf: -0.009079334872: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 342 : printf: -0.07486613408: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 343 : printf: 0.4767429578: nombre non valable
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 356 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 357 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 358 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 359 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 360 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 361 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 2: syntax error
when sim=corratio180: mi_inter=1.539236, cc_inter=0.965485, mi_inter*cc_inter=; mi_full=1.346118, cc_full=0.654469, mi_full*cc_full=.880992501342
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1439 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1442 : [: == : op????rateur unaire attendu
Try using normmi as similarity metric for affine registration, search range [-45, 45]
Try using corratio as similarity metric for affine registration, search range [-45, 45]
Selecting best affine registration results
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 335 : printf: 1.032195984: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 336 : printf: 0.0217732997: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 337 : printf: -0.01392433965: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 338 : printf: -0.0007671974302: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 339 : printf: 1.00972434: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 340 : printf: -0.002290940197: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 341 : printf: 0.01662321697: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 342 : printf: 0.007026530255: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 343 : printf: 0.346018679: nombre non valable
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 356 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 357 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 358 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 359 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 360 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 361 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 2: syntax error
when sim=normmi180: mi_inter=1.561389, cc_inter=0.964641, mi_inter*cc_inter=; mi_full=1.356784, cc_full=0.544964, mi_full*cc_full=.739398435776
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1439 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1442 : [: == : op????rateur unaire attendu
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 335 : printf: 1.033756639: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 336 : printf: -0.02667788233: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 337 : printf: -0.002680037682: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 338 : printf: 0.02833808746: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 339 : printf: 1.032154778: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 340 : printf: 0.0214324315: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 341 : printf: -0.009079334872: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 342 : printf: -0.07486613408: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 343 : printf: 0.4767429578: nombre non valable
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 356 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 357 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 358 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 359 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 360 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 361 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 2: syntax error
when sim=corratio180: mi_inter=1.539236, cc_inter=0.965485, mi_inter*cc_inter=; mi_full=1.346118, cc_full=0.654469, mi_full*cc_full=.880992501342
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1439 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1442 : [: == : op????rateur unaire attendu
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 335 : printf: 1.032127265: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 336 : printf: 0.02199159156: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 337 : printf: -0.01296402945: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 338 : printf: -0.0007672555289: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 339 : printf: 1.009802937: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 340 : printf: -0.002030155028: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 341 : printf: 0.009609101452: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 342 : printf: 0.00511685665: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 343 : printf: 0.3920999932: nombre non valable
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 356 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 357 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 358 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 359 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 360 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 361 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 2: syntax error
when sim=normmi45: mi_inter=1.553466, cc_inter=0.964789, mi_inter*cc_inter=; mi_full=1.352641, cc_full=0.582675, mi_full*cc_full=.788150094675
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1439 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1442 : [: == : op????rateur unaire attendu
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 335 : printf: 1.033504292: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 336 : printf: -0.02611108137: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 337 : printf: -0.002789337568: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 338 : printf: 0.02830705073: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 339 : printf: 1.033626168: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 340 : printf: 0.01791260079: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 341 : printf: -0.001202060891: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 342 : printf: -0.07452644167: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 343 : printf: 0.4839075406: nombre non valable
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 356 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 357 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 358 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 359 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 360 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 361 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 2: syntax error
when sim=corratio45: mi_inter=1.537860, cc_inter=0.965588, mi_inter*cc_inter=; mi_full=1.345989, cc_full=0.660152, mi_full*cc_full=.888557330328
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1439 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1442 : [: == : op????rateur unaire attendu
Try using normmi as similarity metric, -nosearch -2D, for affine registration, default search range [-90, 90]
Try using corratio as similarity metric, -nosearch -2D, for affine registration, default search range [-90, 90]
Selecting best affine registration results
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 335 : printf: 1.032195984: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 336 : printf: 0.0217732997: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 337 : printf: -0.01392433965: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 338 : printf: -0.0007671974302: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 339 : printf: 1.00972434: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 340 : printf: -0.002290940197: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 341 : printf: 0.01662321697: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 342 : printf: 0.007026530255: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 343 : printf: 0.346018679: nombre non valable
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 356 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 357 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 358 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 359 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 360 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 361 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 2: syntax error
when sim=normmi180: mi_inter=1.561389, cc_inter=0.964641, mi_inter*cc_inter=; mi_full=1.356784, cc_full=0.544964, mi_full*cc_full=.739398435776
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1439 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1442 : [: == : op????rateur unaire attendu
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 335 : printf: 1.033756639: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 336 : printf: -0.02667788233: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 337 : printf: -0.002680037682: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 338 : printf: 0.02833808746: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 339 : printf: 1.032154778: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 340 : printf: 0.0214324315: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 341 : printf: -0.009079334872: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 342 : printf: -0.07486613408: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 343 : printf: 0.4767429578: nombre non valable
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 356 : [: == : op????rateur unaire attendu
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(standard_in) 1: syntax error
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/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 358 : [: == : op????rateur unaire attendu
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/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 360 : [: == : op????rateur unaire attendu
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/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 361 : [: == : op????rateur unaire attendu
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(standard_in) 2: syntax error
when sim=corratio180: mi_inter=1.539236, cc_inter=0.965485, mi_inter*cc_inter=; mi_full=1.346118, cc_full=0.654469, mi_full*cc_full=.880992501342
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1439 : [: == : op????rateur unaire attendu
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/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1442 : [: == : op????rateur unaire attendu
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/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 336 : printf: 0.02199159156: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 337 : printf: -0.01296402945: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 338 : printf: -0.0007672555289: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 339 : printf: 1.009802937: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 340 : printf: -0.002030155028: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 341 : printf: 0.009609101452: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 342 : printf: 0.00511685665: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 343 : printf: 0.3920999932: nombre non valable
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/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 356 : [: == : op????rateur unaire attendu
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/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 357 : [: == : op????rateur unaire attendu
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/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 358 : [: == : op????rateur unaire attendu
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/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 359 : [: == : op????rateur unaire attendu
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/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 360 : [: == : op????rateur unaire attendu
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/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 361 : [: == : op????rateur unaire attendu
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(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 2: syntax error
when sim=normmi45: mi_inter=1.553466, cc_inter=0.964789, mi_inter*cc_inter=; mi_full=1.352641, cc_full=0.582675, mi_full*cc_full=.788150094675
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1439 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1442 : [: == : op????rateur unaire attendu
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 335 : printf: 1.033504292: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 336 : printf: -0.02611108137: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 337 : printf: -0.002789337568: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 338 : printf: 0.02830705073: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 339 : printf: 1.033626168: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 340 : printf: 0.01791260079: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 341 : printf: -0.001202060891: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 342 : printf: -0.07452644167: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 343 : printf: 0.4839075406: nombre non valable
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 356 : [: == : op????rateur unaire attendu
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(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 357 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 358 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 359 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 360 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 361 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 2: syntax error
when sim=corratio45: mi_inter=1.537860, cc_inter=0.965588, mi_inter*cc_inter=; mi_full=1.345989, cc_full=0.660152, mi_full*cc_full=.888557330328
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1439 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1442 : [: == : op????rateur unaire attendu
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 335 : printf: 0.9999985099: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 336 : printf: 0.00171114353: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 338 : printf: -0.00171114353: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 339 : printf: 0.9999985099: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 343 : printf: 0.999999932: nombre non valable
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 356 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 357 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 358 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 359 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 360 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 361 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 2: syntax error
when sim=normmi_2D_nosearch: mi_inter=1.500247, cc_inter=0.963382, mi_inter*cc_inter=; mi_full=1.304275, cc_full=0.778788, mi_full*cc_full=1.015753718700
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1439 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1442 : [: == : op????rateur unaire attendu
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 335 : printf: 0.9999001026: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 336 : printf: -0.01413373964: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 338 : printf: 0.01413374301: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 339 : printf: 0.9998998642: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 343 : printf: 1.000000033: nombre non valable
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 356 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 357 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 358 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 359 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 360 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 361 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 2: syntax error
when sim=corratio_2D_nosearch: mi_inter=1.500275, cc_inter=0.964146, mi_inter*cc_inter=; mi_full=1.306141, cc_full=0.782723, mi_full*cc_full=1.022346601943
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1439 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1442 : [: == : op????rateur unaire attendu
Error: Affine registration failed! No affine matrix was saved.
I need help please. I tried to register 2 sacral CT but the procedure fails...
Can you help me please ?
Here is what the verbose showed :
(base) [planet@lito-orsay Desktop]$ dramms -S /home/planet/Desktop/MAR_CT_RECID.nii.gz -T /home/planet/Desktop/MAR_CT_PRERT.nii.gz -O /home/planet/Desktop/MAR_CT_RECID2PRERT.nii.gz -D /home/planet/Desktop/MAR_CT_RECID2PRERT_DEF.nii.gz -v
Automatically mapping regularization weights and label factor to roughly the range [0,1]
Regularization = .35555555555555555554
Label factor = 0.50
Number of Gabor scales = 3
-------------------------------------------------------------------------------------------
DRAMMS: Deformable image Registration via Attribute Matching and Mutual-Saliency weighting
-------------------------------------------------------------------------------------------
----------------------------------------
Registering from
MAR_CT_RECID.nii.gz (in directory /home/planet/Desktop)
to
MAR_CT_PRERT.nii.gz (in directory /home/planet/Desktop),
Registered image will be
MAR_CT_RECID2PRERT.nii.gz (in directory /home/planet/Desktop)
and deformation will be
MAR_CT_RECID2PRERT_DEF.nii.gz (in directory /home/planet/Desktop).
Both registered image and deformation field will be in the same space as MAR_CT_PRERT.nii.gz.
----------------------------------------
Gabor attributes will be computed at 3 scales and in 4 orientations
During discrete optimization, number of samples: 5
Manipulation method of control points: 1
Regularization weight: 0.2
Input mask: NULL
Temporary working directory: /tmp/dramms-VqBDLo
Temporary attribute directory: /tmp/dramms-VqBDLo/features
Intermediate results directory: /tmp/dramms-VqBDLo/intermediate
Changed to directory /tmp/dramms-VqBDLo/intermediate
Step 1: Convert images to byte datatype...
++ WARNING: nifti_read_buffer(/home/planet/Desktop/MAR_CT_PRERT.nii.gz):
data bytes needed = 2048
data bytes input = 49
number missing = 1999 (set to 0)
++ WARNING: nifti_read_buffer(/home/planet/Desktop/MAR_CT_PRERT.nii.gz):
data bytes needed = 2048
data bytes input = 49
number missing = 1999 (set to 0)
Step 2: Match histograms if necessary...
Start to estimate histogram...
TotalIntensityA=1568979839.000000 NonZeroPntsA=18518625.000000
TotalIntensityB=165014657.000000 NonZeroPntsB=9649350.000000
cumulative histogram for A = 1.000000, for B = 1.000000
Entropy A = 4.240346
Entropy B = 2.334679
cumulative histogram for image A:
0.316329 at intensity 12 (perhaps noise),
0.417674 at intensity 51 (lower 1/5 intensity range),
0.984657 at intensity 204 (higher 1/5 intensity range).
cumulative histogram for image B:
0.103504 at intensity 12 (perhaps noise),
0.997653 at intensity 51 (lower 1/5 intensity range),
1.000000 at intensity 204 (higher 1/5 intensity range).
No need to match histogram.
Compare image similarity before and after histogram matching.
before: cc*mi = .715031506181
after : cc*mi = .715031506181
We decided to keep byte images after histogram matching, as histomatch increased image similarity.
Step 3: Affine registration of images by FSL's flirt tool (may take several minutes)...
Try using normmi as similarity metric for affine registration, search range [-180, 180]
Try using corratio as similarity metric for affine registration, search range [-180, 180]
Selecting best affine registration results
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 335 : printf: 1.032195984: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 336 : printf: 0.0217732997: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 337 : printf: -0.01392433965: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 338 : printf: -0.0007671974302: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 339 : printf: 1.00972434: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 340 : printf: -0.002290940197: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 341 : printf: 0.01662321697: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 342 : printf: 0.007026530255: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 343 : printf: 0.346018679: nombre non valable
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 356 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 357 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 358 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 359 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 360 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 361 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 2: syntax error
when sim=normmi180: mi_inter=1.561389, cc_inter=0.964641, mi_inter*cc_inter=; mi_full=1.356784, cc_full=0.544964, mi_full*cc_full=.739398435776
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1439 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1442 : [: == : op????rateur unaire attendu
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 335 : printf: 1.033756639: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 336 : printf: -0.02667788233: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 337 : printf: -0.002680037682: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 338 : printf: 0.02833808746: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 339 : printf: 1.032154778: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 340 : printf: 0.0214324315: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 341 : printf: -0.009079334872: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 342 : printf: -0.07486613408: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 343 : printf: 0.4767429578: nombre non valable
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 356 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 357 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 358 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 359 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 360 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 361 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 2: syntax error
when sim=corratio180: mi_inter=1.539236, cc_inter=0.965485, mi_inter*cc_inter=; mi_full=1.346118, cc_full=0.654469, mi_full*cc_full=.880992501342
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1439 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1442 : [: == : op????rateur unaire attendu
Try using normmi as similarity metric for affine registration, search range [-45, 45]
Try using corratio as similarity metric for affine registration, search range [-45, 45]
Selecting best affine registration results
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 335 : printf: 1.032195984: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 336 : printf: 0.0217732997: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 337 : printf: -0.01392433965: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 338 : printf: -0.0007671974302: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 339 : printf: 1.00972434: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 340 : printf: -0.002290940197: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 341 : printf: 0.01662321697: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 342 : printf: 0.007026530255: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 343 : printf: 0.346018679: nombre non valable
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 356 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 357 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 358 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 359 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 360 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 361 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 2: syntax error
when sim=normmi180: mi_inter=1.561389, cc_inter=0.964641, mi_inter*cc_inter=; mi_full=1.356784, cc_full=0.544964, mi_full*cc_full=.739398435776
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1439 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1442 : [: == : op????rateur unaire attendu
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 335 : printf: 1.033756639: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 336 : printf: -0.02667788233: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 337 : printf: -0.002680037682: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 338 : printf: 0.02833808746: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 339 : printf: 1.032154778: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 340 : printf: 0.0214324315: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 341 : printf: -0.009079334872: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 342 : printf: -0.07486613408: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 343 : printf: 0.4767429578: nombre non valable
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(standard_in) 2: syntax error
when sim=corratio180: mi_inter=1.539236, cc_inter=0.965485, mi_inter*cc_inter=; mi_full=1.346118, cc_full=0.654469, mi_full*cc_full=.880992501342
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/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1439 : [: == : op????rateur unaire attendu
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/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 338 : printf: -0.0007672555289: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 339 : printf: 1.009802937: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 340 : printf: -0.002030155028: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 341 : printf: 0.009609101452: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 342 : printf: 0.00511685665: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 343 : printf: 0.3920999932: nombre non valable
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/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 360 : [: == : op????rateur unaire attendu
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/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 361 : [: == : op????rateur unaire attendu
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(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 2: syntax error
when sim=normmi45: mi_inter=1.553466, cc_inter=0.964789, mi_inter*cc_inter=; mi_full=1.352641, cc_full=0.582675, mi_full*cc_full=.788150094675
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1439 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1442 : [: == : op????rateur unaire attendu
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 335 : printf: 1.033504292: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 336 : printf: -0.02611108137: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 337 : printf: -0.002789337568: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 338 : printf: 0.02830705073: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 339 : printf: 1.033626168: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 340 : printf: 0.01791260079: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 341 : printf: -0.001202060891: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 342 : printf: -0.07452644167: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 343 : printf: 0.4839075406: nombre non valable
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 356 : [: == : op????rateur unaire attendu
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/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 357 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
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/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 358 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
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/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 359 : [: == : op????rateur unaire attendu
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(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 360 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 361 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 2: syntax error
when sim=corratio45: mi_inter=1.537860, cc_inter=0.965588, mi_inter*cc_inter=; mi_full=1.345989, cc_full=0.660152, mi_full*cc_full=.888557330328
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1439 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1442 : [: == : op????rateur unaire attendu
Try using normmi as similarity metric, -nosearch -2D, for affine registration, default search range [-90, 90]
Try using corratio as similarity metric, -nosearch -2D, for affine registration, default search range [-90, 90]
Selecting best affine registration results
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 335 : printf: 1.032195984: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 336 : printf: 0.0217732997: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 337 : printf: -0.01392433965: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 338 : printf: -0.0007671974302: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 339 : printf: 1.00972434: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 340 : printf: -0.002290940197: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 341 : printf: 0.01662321697: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 342 : printf: 0.007026530255: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 343 : printf: 0.346018679: nombre non valable
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/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 356 : [: == : op????rateur unaire attendu
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(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 357 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 358 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 359 : [: == : op????rateur unaire attendu
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(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 360 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 361 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 2: syntax error
when sim=normmi180: mi_inter=1.561389, cc_inter=0.964641, mi_inter*cc_inter=; mi_full=1.356784, cc_full=0.544964, mi_full*cc_full=.739398435776
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1439 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1442 : [: == : op????rateur unaire attendu
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 335 : printf: 1.033756639: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 336 : printf: -0.02667788233: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 337 : printf: -0.002680037682: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 338 : printf: 0.02833808746: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 339 : printf: 1.032154778: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 340 : printf: 0.0214324315: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 341 : printf: -0.009079334872: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 342 : printf: -0.07486613408: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 343 : printf: 0.4767429578: nombre non valable
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 356 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 357 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 358 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 359 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 360 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 361 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 2: syntax error
when sim=corratio180: mi_inter=1.539236, cc_inter=0.965485, mi_inter*cc_inter=; mi_full=1.346118, cc_full=0.654469, mi_full*cc_full=.880992501342
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1439 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1442 : [: == : op????rateur unaire attendu
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/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 338 : printf: -0.0007672555289: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 339 : printf: 1.009802937: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 340 : printf: -0.002030155028: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 341 : printf: 0.009609101452: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 342 : printf: 0.00511685665: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 343 : printf: 0.3920999932: nombre non valable
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 356 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 357 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 358 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 359 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 360 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 361 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 2: syntax error
when sim=normmi45: mi_inter=1.553466, cc_inter=0.964789, mi_inter*cc_inter=; mi_full=1.352641, cc_full=0.582675, mi_full*cc_full=.788150094675
(standard_in) 1: syntax error
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(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1442 : [: == : op????rateur unaire attendu
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 335 : printf: 1.033504292: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 336 : printf: -0.02611108137: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 337 : printf: -0.002789337568: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 338 : printf: 0.02830705073: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 339 : printf: 1.033626168: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 340 : printf: 0.01791260079: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 341 : printf: -0.001202060891: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 342 : printf: -0.07452644167: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 343 : printf: 0.4839075406: nombre non valable
(standard_in) 1: syntax error
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/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 359 : [: == : op????rateur unaire attendu
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/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 360 : [: == : op????rateur unaire attendu
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(standard_in) 2: syntax error
when sim=corratio45: mi_inter=1.537860, cc_inter=0.965588, mi_inter*cc_inter=; mi_full=1.345989, cc_full=0.660152, mi_full*cc_full=.888557330328
(standard_in) 1: syntax error
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(standard_in) 1: syntax error
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/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 335 : printf: 0.9999985099: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 336 : printf: 0.00171114353: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 338 : printf: -0.00171114353: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 339 : printf: 0.9999985099: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 343 : printf: 0.999999932: nombre non valable
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/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 358 : [: == : op????rateur unaire attendu
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(standard_in) 1: syntax error
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/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 360 : [: == : op????rateur unaire attendu
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/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 361 : [: == : op????rateur unaire attendu
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(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 2: syntax error
when sim=normmi_2D_nosearch: mi_inter=1.500247, cc_inter=0.963382, mi_inter*cc_inter=; mi_full=1.304275, cc_full=0.778788, mi_full*cc_full=1.015753718700
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1439 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1442 : [: == : op????rateur unaire attendu
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 335 : printf: 0.9999001026: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 336 : printf: -0.01413373964: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 338 : printf: 0.01413374301: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 339 : printf: 0.9998998642: nombre non valable
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 343 : printf: 1.000000033: nombre non valable
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 356 : [: == : op????rateur unaire attendu
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/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 357 : [: == : op????rateur unaire attendu
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/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 358 : [: == : op????rateur unaire attendu
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/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 361 : [: == : op????rateur unaire attendu
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(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 1: syntax error
(standard_in) 2: syntax error
when sim=corratio_2D_nosearch: mi_inter=1.500275, cc_inter=0.964146, mi_inter*cc_inter=; mi_full=1.306141, cc_full=0.782723, mi_full*cc_full=1.022346601943
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1439 : [: == : op????rateur unaire attendu
(standard_in) 1: syntax error
/home/planet/dramms/bin/dramms: ligne 1442 : [: == : op????rateur unaire attendu
Error: Affine registration failed! No affine matrix was saved.